Istituito presso la Stazione di Biologia marina, il museo ha una sezione malacologica e presenta rare varietà di fauna e flora marine raccolte in varie parti del mondo oltre che nel mar Ionio; una sala è dedicata alla cultura della pesca di Porto Cesareo, con modelli in resina dipinti a mano delle principali specie ittiche della zona, corredati da pannelli esplicativi con le varie tecniche di pesca. Nella nuova sala dello squalo elefante è esposto un esemplare di 7 metri, con approfondimenti sulla vita degli squali, sul plancton e sul meccanismo di filtrazione che molti animali marini usano per alimentarsi