Allestito nella sala capitolare del convento francescano, il museo accoglie preziosi reliquiari, dipinti, sculture e oggetti sacri di epoca gotica, rinascimentale e barocca appartenuti all’istituto monastico. Si notino in particolare un Ecce Homo di Francesco Francia (XV secolo), icone cinquecentesche e, tra le oreficerie sacre, una Croce processionale realizzata intorno al 1440. Particolari sono la raccolta degli strumenti dell’antico laboratorio farmaceutico, con vasi da manifatture italiane e olandesi, alambicchi, mortai e bilance di precisione, e la collezione di gioielli ex voto, nella quale spiccano i raffinati monili realizzati a Ragusa con la tradizionale lavorazione della filigrana (XVII-XIX secolo). Nel museo sono esposti anche alcuni volumi provenienti dalla biblioteca del convento, una tra le più vaste in Croazia, che vanta 1200 manoscritti, più di 100 incunaboli, cinquecentine e rari testi sacri.