Preceduta da una spiaggia lunga e attrezzata, la foce di Varano segna l'ingresso nell'isola di Varano, anch'essa lambita da un lunghissimo arenile alle cui spalle è un folto bosco a pini e macchia mediterranea. Lo stretto istmo separa l'invaso salmastro dal mare. Lungo circa 10 km e largo 7,5, lo alimentano sorgenti subacquee e alle sue sponde fanno da cornice le montagne del Gargano. Ne segna il confine occidentale la foce di Capoiale, suggestivo porto canale.