La collezione sistematica, la collezione di giacimenti minerari, la collezione genetica, la collezione regionale «G. Gasser» costituiscono la più importante documentazione mineralogica del Veneto, sia sotto il profilo scientifico sia storico. Fanno da cornice le interessanti collezioni tematiche (gemme, fenomeni, cristalli, meteoriti, minerali fluorescenti). Inoltre il museo ospita attrezzature e strumenti otto-novecenteschi per le analisi e lo studio dei minerali, alcuni modelli di strutture cristalline e antichi testi di mineralogia con mirabili illustrazioni