Il chiostro del convento di S. Francesco accoglie la pinacoteca, dove sono esposte opere provenienti dall'ex convento dei Cappuccini delle scuole di Presutti, Barocci e Guerrieri. Pregevole il tabernacolo in legno di ciliegio e noce scolpito con intarsi in marmo e osso levigato, opera di Fra Liberato da Macerata. Il museo conserva inoltre manoscritti, incunaboli e cinquecentine, e antichi volumi a stampa anch'essi originariamente collocati nel convento dei Cappuccini