Il museo, formatosi nella seconda metà dell'Ottocento, dal 2001 è situato all'interno dell'antico palazzo Pergami-Belluzzi. Espone materiali riguardanti la storia e l'arte sammarinesi: reperti archeologici dall'età della pietra all'età barbarica (tra i quali la fibula d'oro del tesoro goto di Domagnano), frammenti architettonici romanici e rinascimentali, sculture e dipinti del Guercino, di Elisabetta Sirani e del Batoni. Espone inoltre, distinti dal resto, nuclei di donazione di materiale archeologico e artistico molto ricchi e di svariata provenienza (reperti egizi, greci, etruschi e romani; dipinti di Michele Giambono, Tiburzio Passerotti, Bernardo Strozzi, Aniello Falcone e sculture di Baccio Bandinelli e Guglielmo della Porta). La collezione dell'antica monetazione sammarinese completa il museo, che ha un apposito spazio per l'allestimento di piccole mostre contemporanee