È nato grazie a un gruppo di appassionati che per anni ha offerto il proprio lavoro volontario, organizzando quello che oggi è il Museo ferroviario. L’ingresso si trova in via Giulio Cesare, sul fianco orientale della stazione, che architettonicamente è il lato più interessante. Il patrimonio di ricordi e oggetti della storia ferroviaria della Venezia Giulia è esposto nella ex zona partenze, in ambienti severi ma di grande eleganza anche nei dettagli e nelle finiture. Sui binari della stazione sono parcheggiati vagoni e locomotive storiche; fanno parte del fondo museale anche alcuni tram del servizio urbano della città.