All'interno del museo sono esposti arredi sacri di filo-oro, vestiari appartenuti ad alcuni papi e tele del Seicento. Riorganizzato nel 1974, in occasione del bicentenario della nascita del beato Stefano Bellesini, conserva gli arredi delle stanze del sacerdote agostiniano che si dedicò alla cura pastorale, all'educazione dei fanciulli elevato agli onori degli altari da papa Pio X