Istituito nella sede della Facoltà, nel Palazzo delle Scienze, conserva reperti fossili, in prevalenza malacologici ma anche vertebratologici, dal Paleozoico al Quaternario, e provenienti sia dal territorio siciliano sia da altre regioni italiane, europee ed extraeuropee. Tra i reperti più significativi si segnalano lo scheletro completo di Elephas falconeri, il più piccolo elefante mai vissuto sul pianeta, proveniente dalla grotta di Spinagallo (Siracusa), risalente a circa 500.000 anni fa, e una collezione di pesci fossili provenienti dal territorio di Caltanissetta databili a circa 7 milioni di anni fa. Comprende inoltre materiali vulcanologici e che riguardano in particolare la Sicilia: esemplari di lava a corde, di bombe vulcaniche, i plastici delle eruzioni dell'Etna e i rilievi di vulcani italiani, gli esemplari di zolfo, i minerali della serie evaporitica (zolfo, celestina, aragonite) della Sicilia centrale. Il materiale è ospitato nel dipartimento di Scienze geologiche dell'Università di Catania