La costituzione del museo è legata ad alcune donazioni significative: il fondo G.B. Dell'Era, composto da tele a olio e tempera, disegni, cartoni; la donazione Della Torre, che rappresenta il nucleo più consistente, il fondo Grossi di ritratti ottocenteschi. Altre sezioni del museo sono costituite da un interessante nucleo storico-archeologico cittadino, dalle donazioni Cassani, Longaretti e da opere provenienti dall'ex monastero di S. Pietro. È stata recentemente aperta una sezione scientifica del museo presso la sede distaccata di piazza Mercato