Nelle sale del museo sono esposti centinaia di reperti e materiali trovati nel territorio fossatano, esposti in sequenza cronologica e allestiti per nuclei cronologicamente coerenti e culturalmente organici. Attraverso i reperti e i pannelli esplicativi vengono documentate le vicende di queste terre nel tempo e la struttura organizzativa territoriale, da sempre determinata dall'attraversamento incrociato della Consolare Flaminia e dallo scavalcamento montano che dai territori umbri interni porta a quelli transappenninici e alla costa adriatica