Questo museo (al primo piano del palazzo del Collegio, ma ne è previsto il trasferimento nel complesso archeoindustriale di calata Anselmi, dove dovrebbero confluire anche reperti di archeologia subacquea) raccoglie materiali relativi alla storia della marineria mediterranea e oceanica. L’istituzione offre validi spunti d’interesse nelle sezioni dedicate alla vita di bordo.