Il museo contiene una ricca collezione di oggetti, paramenti, manufatti artistici e un'accurata riscostruzione della storia archittetonica del Duomo. Dedica una sala alla Vara, il fercolo di S. Agata, con cui vengono portati in processione i reliquari della santa patrona; si tratta di una grandiosa macchina lignea rivestita in lamina d'argento.