Il museo è ospitato nella ex chiesa cinquecentesca del Gesù, ed espone opere provenienti da chiese della diocesi.<br>Sono particolarmente notevoli capolavori di Pietro Lorenzetti (Crocifisso su tavola), del Beato Angelico (Annunciazione), di Bartolomeo della Gatta, del Sassetta (Madonna col Bambino, angeli e santi), e di Luca Signorelli (Deposizione).<br>Il museo è importante anche per un sarcofago romano con Lapiti e Centauri (secondo secolo dopo Cristo) ritrovato presso il Duomo, e per la raccolta di oreficerie, arredi e paramenti sacri.