La chiesa ebbe origine da un oratorio, costruito nel 1506 presso una sorgente cui la tradizione attribuiva virtù taumaturgiche. Anche se restaurata a metà del ’900, S. Maria alla Fontana ha mantenuto l’originario impianto cinquecentesco. Ha pianta quadrata, e un’elegante parata di archi su pilastri, con tondi in cotto di sapore bramantesco. Il santuario, addossato al presbiterio, si trova più in basso rispetto al piano stradale odierno.