Nel nuovo complesso museale, inaugurato nel giugno 2004, trovano sede le raccolte del Museo di arti applicate e decorative e il Museo Bottacin. Nel primo sono sistemati oltre 2.000 oggetti appartenenti alle raccolte del Civico Museo d'Arte medioevale e moderna: vetri, intagli, ceramiche, argenti, avori, gioielli, tessili, mobilio. Un numero elevato di pezzi, che illustra differenti tipologie di manufatti in uso a Padova tra medioevo e seconda metà dell'Ottocento. Il secondo museo espone le raccolte di monete e medaglie, dipinti, mobili, sculture, ceramiche cinesi, armi antiche e altre opere di Nicola Bottacin, il commerciante che verso la metà dell'Ottocento legò alla città il suo patrimonio d'arte e monete