Ha come scopo la diffusione della cultura naturalistica e la conservazione dell'ambiente attraverso la raccolta, lo studio e l'esposizione al pubblico di reperti naturali provenienti dal territorio provinciale e regionale. È suddiviso in sei sezioni: Sala delle zone umide; Sala delle scienze della terra; Sala dell'ecologia; Sala degli ambienti forestali; Sala degli ambienti di prateria; Sala dell'avifauna italiana. Il museo organizza anche laboratori ed escursioni naturalistiche per le scuole