Il museo, allestito presso l'Istituto talassografico, raccoglie esemplari marini raccolti del golfo di Taranto e di altri mari, temperati o tropicali; sono presenti, in particolar modo, molluschi, pesci, echinodermi, celenterati, spugne. Da segnalare un esemplare di ostrica gigante Tridacna gigas