La chiesa fu costruita nel 1580-1603 su una fondazione paleocristiana. I lavori di restauro successivi al bombardamento del 1945 vi hanno portato in luce i resti di una chiesa romanica e due piccole aule paleocristiane con frammenti di affresco. Nell’interno si ammirano il Battesimo di S. Afra di Francesco Bassano il Giovane e, dietro l’altar maggiore, la Trasfigurazione di Jacopo Tintoretto.