Il museo si trova all'interno di Palazzo Chigi in Ariccia, esempio unico di dimora barocca a opera di Gian Lorenzo Bernini e documento del prestigio di una delle più grandi casate papali italiane: i Chigi. Si affianca alla collezione permanente Chigi, allestita al piano nobile del palazzo e nell'appartamento privato del cardinale Flavio Chigi, e comprende la donazione dello storico dell'arte Maurizio Fagiolo dell'Arco e successive altre donazioni e acquisizioni, fra cui la collezione Fagiolo, alcune opere della collezione Koelliker e la biblioteca Chigi. Propone al pubblico anche la collezione Lemme, importante quadreria di nuova formazione, con dipinti del Seicento e Settecento romano