Comprende una sezione archeologica (reperti dalla Daunia, ceramiche a figure rosse e stele, corredi tombali da Arpi, la tomba dei Cavalieri, affrescata, e la tomba della Medusa), una pinacoteca con opere di autori meridionali, una sezione riguardante le tradizioni popolari (interessanti i manufatti di artigianato dauno) e un lapidario.