Il museo, realizzato nel 1997 all'interno dello stabilimento di San Sisto, è inserito nella Casa del Cioccolato Perugina, inaugurata nel 2007 in occasione del centenario dell'azienda. Il percorso si articola in quattro sezioni: la prima sulla scoperta, la storia e la lavorazione del cacao fino all'attuale cultura del cioccolato; le altre sullo sviluppo dell'azienda dolciaria, con documenti sulla storia del laboratorio artigianale dal 1907, i prodotti e le reti di vendita, la comunicazione e la pubblicità. Sono inoltre esposti alcuni macchinari impiegati nella produzione dolciaria e alcune serie di confezioni classiche utilizzate nel tempo dalla Perugina. Completano il percorso alcune postazioni video con filmati di repertorio e pubblicitari dell'azienda, tra cui la raccolta di tutte le réclames da Carosello ai moderni spot