Tra il 1943 e il 1945, dal binario 21 partirono treni carichi di deportati diretti verso i campi di concentramento nazisti. Dal 2013 Milano denuncia quell’orrore e ne ricorda le vittime con il Memoriale della Shoah (accesso su prenotazione da piazza Safra) che si sviluppa nelle gallerie della stazione, presso il deposito utilizzato dai tedeschi per caricare i deportati sui vagoni merci. Sul muro dei Nomi sono elencate tutte le vittime.