L'erbario dell'Università di Bologna, uno dei più antichi d'Europa, conserva piante essiccate raccolte dal Cinquecento in poi; la sua consistenza attuale è valutata in circa 110.000 esemplari. Campioni delle collezioni più significative sono esposti in una sala del museo, dove è illustrata anche la storia dell'Orto botanico. Fondato da Ulisse Aldrovandi (1522-1605) in un cortile di Palazzo pubblico, si estende oggi su una superficie complessiva di circa 2 ettari e ospita più di 5.000 esemplari di piante locali ed esotiche