Sede del museo è il castello di S. Martino della Vaneza, in epoca veneziana attrezzato a stazione commerciale sul Bacchiglione. I reperti provengono dal fiume Bacchiglione: tra quelli più singolari, che vanno dall'età del Bronzo all'epoca longobarda, alcune imbarcazioni ricavate da tronchi di quercia risalenti all'VIII secolo d.C. Un'altra sezione è dedicata alle ceramiche, principalmente medievali e rinascimentali