Affacciato al corridoio della Grande Caccia, sul lato est, è il complesso della grande basilica, spaziosa aula rettangolare, incurvantesi in una grande abside, destinata ai ricevimenti ufficiali. Ai due lati della basilica, con accesso dall'esterno, si allineano varie stanze costituenti gli appartamenti privati, tutte decorate di splendidi mosaici* pavimentali. Si notino in particolare quelle meridionali: Arione tratto in salvo da un delfino con corteggio di Naiadi e mostri marini, gare di fanciulli nel circo, lotta di Eros e Pan, fanciulli cacciatori. Nei locali a nord della basilica, accessibili aggirandone l'abside, il mosaico di Ulisse e Polifemo, considerato tra i più belli della villa, e un tondo con scena erotica.