Il museo è ospitato all'interno della rocca rinascimentale, da poco ristrutturata. Il percorso museale si articola in più parti: nel Sotto si affrontano le tematiche relative alla geologia dell’Appennino umbro: dalla formazione delle tre catene montuose principali al lago Tiberino, dall’ambiente di vita delle ammoniti alla cascata delle Marmore alla formazione delle grotte; nel Sopra si tratta l’aspetto naturalistico dell’Appennino, la flora e la fauna attraverso una serie di giochi didattici che portano alla lettura dei segni e delle tracce che gli animali lasciano sul territorio, allo studio degli alberi con le loro foglie e frutti, il tutto attraverso percorsi interattivi, giochi didattici ed esperienze che entusiasmano adulti e bambini