Il museo, allestito dall'Associazione protostorica alta Valle del Tevere, è ospitato in un locale della biblioteca comunale. Interessante la raccolta di fossili di varia provenienza dal Paleozoico al Cenozoico; i fossili e i resti animali rinvenuti nell'alta Valtiberina; i primi rudimentali utensili (ciottoli scheggiati, punte, picconi, lame) del Paleolitico e del Neolitico provenienti da Marche, Abruzzo, Basilicata; una collezione di strumenti in pietra dal Paleolitico al Neolitico provenienti da Algeria, Marocco, Libia; reperti riferibili alla civiltà appenninica e subappenninica dalle grotte del Parrano (Umbria) e dai terrazzi del fiume Nevola (Marche); reperti di età etrusco-romana che appartengono per lo più al territorio del comune di Città di Castello e al suo comprensorio; materiale recuperato dagli scavi presso il villaggio neolitico di Campolongo