La sezione museale pittorica nel palazzo – ovvero la Pinacoteca, istituita nel 1870 – documenta la pittura umbra e folignate nei secoli XIV-XVI.<br>Importante la raccolta di affreschi staccati da edifici della città, di mano di artisti quali Bartolomeo di Tommaso, Pier Antonio Mezzastris, Giovanni di Corraducclo; inoltre, nucleo di affreschi frammentari di fine '300. Per il '500, dipinti di Bernardino Mezzastris, Dono Doni, Ascensidonio Spacca.<br>La sezione archeologica, avviata dall'Accademia Fulginia (1762), illustra la storia del territorio folignate, evidenziando la precoce romanizzazione della città posta lungo la Via Flaminia. Di particolare rilievo, il nucleo delle sculture antiche collezionate nel '400 dai Trinci, raro esempio di raccolta sistematica del tempo. Tra i materiali: Amore e Psiche (II sec.); statua di togato (I sec.); rilievo con Hermes e l'ariete (II-III sec.); rilievo del circo (IV sec.).